Identifikasi Molekular Bakteri Endofit dari Akar Pauh (Mangifera sumatrana Miq) dan Aktivitas Antimikrobanya

Muthia Miranda Zaunit; Verawati Verawati; Irwandi Irwandi; Yolla Sarni Elfionita

doi:10.33653/jkp.v11i1.1067

Muthia Miranda Zaunit Fakultas Farmasi, Universitas Perintis Indonesia, Sumatra Barat, Indonesia
Verawati Verawati Fakultas Farmasi, Universitas Perintis Indonesia, Sumatra Barat, Indonesia
Irwandi Irwandi Fakultas Farmasi, Universitas Perintis Indonesia, Sumatra Barat, Indonesia
Yolla Sarni Elfionita Fakultas Farmasi, Universitas Perintis Indonesia, Sumatra Barat, Indonesia

DOI: https://doi.org/10.33653/jkp.v11i1.1067

Keywords: Mangifera sumatrana, bakteri endofit, aktivitas antimikroba, akar pauh

Abstract

Bakteri endofit merupakan bakteri yang mampu menghasilkan senyawa-senyawa bioaktif yang sama dengan tanaman inangnya. Salah satunya tumbuhan yang potensial adalah pauh (Mangifera sumatrana Miq.). Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengisolasi dan menguji aktivitas antimikroba dari bakteri endofit dari akar pauh terhadap Staphylococcus aureus, Escherichia coli, dan Candida albicans serta melakukan identifikasi secara molekuler menggunakan gen 16S rRNA terhadap bakteri endofit yang memiliki aktivitas antimikroba terkuat. Hasil penelitian ini didapatkan 4 isolat yaitu AL1, Al2, AD1, dan AD2 yang memiliki karakteristik morfologi berupa bentuk tidak beraturan dan bulat, permukaan timbul datar, tepian nya ada yang bergelombang, bergerigi, dan berserabut, serta warna koloni rata-rata putih susu. Hasil uji aktivitas antimikroba dengan metode Kirby-Bauer terhadap Staphylococcus aureus pada isolat AL1, AD1, dan AD2 maka didapatkan zona hambat sebagai berikut: 11,10 mm, 8,60 mm, dan 8,00 mm. Uji aktivitas terhadap Escherichia coli dan Candida albicans tidak memiliki aktivitas antimikroba. Identifikasi molekuler menunjukkan bahwa isolat AL memiliki aktivitas antimikroba terbesar dan memiliki kemiripan 99,91% dengan Lysinibacillus macrolides.

Downloads

Download data is not yet available.

References

Akihary, C. V. and Kolondam, B. J. (2020) ‘Pemanfaatan gen 16S rRNA sebagai perangkat identifikasi bakteri untuk penelitian-penelitian di Indonesia’, Pharmacon, 9(1), p. 16. doi: 10.35799/pha.9.2020.27405.

Anggraeni, V. J., Yulianti, S. and Panjaitan, R. S. (2020) ‘Artikel Review: Fitokimia Dan Aktivitas Antibakteri Dari Tanaman Mangga (Mangifera indica L)’, Indonesia Natural Research Pharmaceutical Journal, 5(2), pp. 102–113.

Anjum, N. and Chandra, R. (2015) ‘Endophytic bacteria: Optimizaton of isolation procedure from various medicinal plants and their preliminary characterization’, Asian Journal of Pharmaceutical and Clinical Research, 8(4), pp. 233–238. Available at: https://www.researchgate.net/publication/282240458_Endophytic_bacteria_Optimizaton_of_isolation_procedure_from_various_medicinal_plants_and_their_preliminary_characterization.

Bell, B. G. et al. (2014) ‘A systematic review and meta-analysis of the effects of antibiotic consumption on antibiotic resistance’, BMC Infectious Diseases, 14(1), pp. 1–25. doi: 10.1186/1471-2334-14-13.

Coorevits, A. et al. (2012) ‘Lysinibacillus macroides sp. nov., nom. rev’, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 62(5), pp. 1121–1127. doi: 10.1099/ijs.0.027995-0.

Firdous, J. et al. (2019) ‘Endophytic bacteria and their potential application in agriculture: A review’, Indian Journal of Agricultural Research, 53(1), pp. 1–7. doi: 10.18805/IJARe.A-366.

Fitmawati, A., Suwita, N. and Sofiyanti, H. (2013) ‘Eksplorasi dan karakterisasi keanekaragaman plasma nutfah mangga (Mangifera) di Sumatera Tengah’, in Prosiding Semirata FMIPA Universitas Lampung, pp. 307–312.

Fitmawati, F. et al. (2020) ‘Antioxidant (gallic acid and quercetin) profile of Sumatran wild mangoes (Mangifera spp.): a potential source for antidegenerative medicine’, F1000Research, 9, p. 220. doi: 10.12688/f1000research.22380.1.

Masud Parvez, G. and Masud Parvez, C. G. (2016) ‘Pharmacological Activities of Mango (Mangifera Indica): A Review’, Journal of Pharmacognosy and Phytochemistry JPP, 1(53), pp. 1–7.

Maulidia, V. et al. (2020) ‘Secondary metabolites produced by endophytic bacteria against the root-knot nematode (Meloidogyne sp.)’, Biodiversitas, 21(11), pp. 5270–5275. doi: 10.13057/biodiv/d211130.

Mohammad, Q. and Jamal, S. (2022) ‘Lysinibacilli : A Biological Factories Intended for diseases genus Lysinibacillus’, journal of Fungi, 8(1288), pp. 1–19.

Rinanda, T. (2011) ‘Analisis Sekuensing 16S rRNA Di Bidang Mikrobiologi’, Jks, 3, pp. 172–177.

Rossiter, S. E., Fletche, M. H. and William M. Wuest (2017) ‘Natural products as platforms to overcome antibiotic resistance’, Chem Rev, 117(12), pp. 139–148. doi: 10.1021/acs.chemrev.7b00283.Natural.

Tortoli, E. (2010) ‘Standard operating procedure for optimal identification of mycobacteria using 16S rRNA gene sequences’, Standards in Genomic Sciences, 3(2), pp. 145–152. doi: 10.4056/sigs.932152.

Wahyu Hidayati, W. et al. (2017) ‘Screening And Identification Endophytic Bacteria From Indonesian Bay Leaves (Eugenia polyantha WIGHT) With Antibacteria Activity’, Prosiding Seminar Nasional Berseri, 1(2), pp. 167–176.

Zaunit, M. M. et al. (2022) ‘Isolasi dan Identifikasi Bakteri Endofit Dari Daun Pauh (Mangifera sumatrana Miq.) serta Uji Aktivitas Antimikroba’, Jurnal Katalisator, 7(2), pp. 379–387. doi: 10.22216/KATALISATOR.V7I2.1581.

Zaunit, M. M., Putri, S. A. and Fera, O. (2023) ‘Potential of Endophytic Bacteria from Pauh Stems ( Mangifera sumatrana Miq ) as Antimicrobials’, Jurnal Farmasi, Kesehatan dan Sains, 1(3), pp. 192–200.

Zhang, Q. et al. (2019) ‘Endophytic bacterial communities associated with roots and leaves of plants growing in chilean extreme environments’, Scientific Reports, 9(1), pp. 1–12. doi: 10.1038/s41598-019-41160-x.